1.用窗簾遮蓋光線，關閉房間內的燈光，除去顯微鏡的防塵罩，確保顯微鏡燈室通風良好、無遮蓋。裝上汞燈燈箱，并轉動燈箱卡圈上的撥桿，將燈箱與鏡臂銜接。

2.將汞燈燈箱的電源插頭插入熒光電源箱后的插座，再將熒光電源箱的插頭插入220V外接電源。

3.翻開電源開關，電壓表顯現出電源電壓，如電源電壓動搖不大于額定電壓值的±5%，即可按下啟動開關點燃汞燈，如因天氣太冷或電壓不穩定等緣由，一次啟動未點燃汞燈，能夠多啟動幾次。待超高壓汞燈弧光到達穩定狀態并到達發光效率，即可開端工作。

4.燈泡的調節：

（1）任選一塊標本放在載物臺上；

（2）轉動鏡臂上的聚光鏡旋鈕使聚光鏡移出光路，轉動濾色片組轉換手輪，將紫光(V)或藍光(B)或綠光(G)激起濾色片組轉入光路，并將10X熒光物鏡轉入光路；

（3）調理粗微調手輪，將標本像調焦明晰；

（4）前后推進垂直照明器右邊的聚光鏡調焦推桿，使視場光欄成像明晰，轉動視場光欄撥桿將視場光欄收小，調理視場光欄調中螺釘使視場光欄居中，然后再將視場光欄開至；

（5）轉動鏡臂上的聚光鏡旋鈕使聚光鏡移入光路，前后調理燈箱上的聚光鏡撥桿，使汞燈的弧光在視場內成像明晰；

（6）調整燈箱上的燈泡程度調理螺釘和垂直調理螺釘，使汞燈的弧光居中；

（7）調整反光鏡程度調理螺釘和垂直調理螺釘，使光源的反射像與汞燈的弧光分開；

（8）轉動聚光鏡旋鈕把聚光鏡移出光路，此時視場照明平均。

5.熒光察看：

（1）將熒光染色標本放到載物臺上。

（2）將10X平場物鏡或40X熒光物鏡轉入光路，調理載物臺縱橫挪動手輪，將標本移入光路。

（3）轉動濾光片轉換撥輪，將熒光染色標本所需求的激起濾光片組轉入光路。激起濾光片組編號刻在濾片組轉換撥輪上。濾光片選擇正確與否，是熒光顯微鏡能否得到正確應用的關鍵。選用濾光片時，必需恪守斯托克斯定律：激起濾光片的透射波長<雙色束別離器的透射波長<阻斷濾光片的透射波長。

由于激起濾光片、雙色束別離器和阻斷濾光片，出廠時已按其用處和自身的光學特性停止了嚴厲的組合匹配，在察看和攝影時，只需選擇濾光片組即可。

（4）調理粗調手輪，當看清熒光圖像輪廓后，再用微調手輪調焦，直至看到明晰的熒光圖像。

（5）當需求得到較強的熒光圖像時，可轉動聚光鏡旋鈕把聚光鏡移入光路，可取得較亮堂的熒光圖像。

（6）當需求運用40X或100X熒光物鏡察看時，應在標本和物鏡間加上甘油，油中不能有影響察看的小泡或雜質。運用時可使甘油漸漸浸潤一會兒，然后緩緩左右來回轉動物鏡轉換器以掃除氣泡。

6.熒光顯微攝影—顯微鏡攝像頭

由于熒光圖像普通均較明場察看暗得多，所以停止熒光顯微攝影需求較長的曝光時間，在曝光時應留意防止儀器震動。

熒光顯微鏡攝影技術關于記載熒光圖像非常必要，由于熒光很易褪色削弱，要即時攝影記載結果。辦法與普通顯微攝影技術根本相同。